宮古の自然と歴史、民俗、文化を明らかにすることを目的に平成元年11月1日に開館しました。 外観は、「仲宗根豊見親の墓」（国指定文化財）がモチーフ、宮古島独特の風土を感じられる博物館。

南風原文化センターは、町立の博物館施設として、南風原・沖縄に関する資料の展示を行っています。常設展示は「南風原の沖縄戦」、「戦後・ゼロからの再建」、「移民」、「人々の暮らし」の４つのコーナーに分かれています。 施設に隣接する黄金森（こがねもり）には、沖縄戦時に沖縄陸軍病院が使用した壕群が残され、その案内もおこなっています。南風原文化センターにある病院壕の再現展示と合わせて黄金森の戦争遺跡を見学することで、戦争と平和について深く考えることができます。

県内在住外国人宅でのホームステイ・日帰りホームビジット「まちなか留学」（外国人宅を訪問し、一緒に料理や交流を行います。）や、「まちなかENGLISH QUEST（通称まちクエ）」（多国籍のイングリッシュスピーカーとチームを組んで、ミッションをクリアしていく新感覚の国際交流プログラム。）等、さまざまな探究・国際交流プログラムを提供しております。

沖縄県内のホテルや施設での星空鑑賞プログラムが行えます。 昼過ごした場所が、夜になると表情が変わる。そんな特別感も味わってもらえます。 世界遺産の城跡などでも開催が可能ですので、琉球王国時代に生きた武将や城に暮らした人々が仰ぎ見た景色を、現代を生きるみなさまにもご覧いただけます。 星空は何千年も変わらずにあるからこそ、いつかふと星空を見上げた時、修学旅行の思い出がきっと蘇ります。

沖縄ならではの体験を通して多様な視点から主体的に考え、沖縄の大学生と共に対話型交流（ディスカッション）を行う沖縄修学旅行の実施。 オンラインでの事前・事後学習を通して学びの深化を図ります。