宮古の自然と歴史、民俗、文化を明らかにすることを目的に平成元年11月1日に開館しました。 外観は、「仲宗根豊見親の墓」（国指定文化財）がモチーフ、宮古島独特の風土を感じられる博物館。

イリオモテヤマネコをはじめとする希少野生生物や西表島の自然について知ってもらい、野生生物への理解や関心を深めるための普及啓発活動や絶滅のおそれのある野生生物の保護、研究を行うために設立されました。2022年には、西表島の自然や保全の取り組みについて、楽しく、分かりやすく、より深く学べるように展示をリニューアルしました。

沖縄県北部の名護市にございます。 観光名所で有名な【沖縄海洋博記念公園・美ら海水族館】から車で約２０分の場所に位置しており無料の大型駐車場（大型バス20台）も完備しています。 那覇空港からは車で高速道路を利用し約８０分となります。 　当施設は、トロピカルテーマパーク（入園）、レストラン（最大800名）、フルーツカフェ、ショッピングをご利用できる複合型の観光入場施設で、長年国内の修学旅行の団体様を受入れさせていただいております。

琉球王国最高の聖地として王府が直接管理をし、最高神女聞得大君の就任儀式や国の吉凶を占う儀式などを行った聖地で、2000年12月に「琉球王国のグスク及び関連遺産群」として世界遺産に登録されてます。

石垣島出身の漁業者である結さんご石垣島のメンバーが、減っていくサンゴ礁を危惧しサンゴ養殖を始めて10年。これまでの活動や経験を基に、広くサンゴや沖縄 の海を知ってもらえたらと体験学習を実施しています。